Anfíbios
Para a amostragem de anfíbios (p.ex. sapos, rãs e pererecas), foram aplicados distintos métodos de captura: procura limitada por tempo (busca dos animais na vegetação, dentro de lagoas e riachos e outros locais), armadilha de interceptação e queda (baldes instalados ao chão), armadilhas do tipo covo (redes que ficam dentro da água e capturam cágados, serpentes e pequenos jacarés) e buscas nas estradas e acessos (animais atravessando). Foram registradas 36 espécies de anfíbios, sendo 24 endêmicas, a maioria da Mata Atlântica, algumas do Cerrado e outras de complexos serranos de Minas Gerais, e seis foram consideradas raras. Além disso, foi possível registrar uma perereca que está presente na lista de ameaça.
Répteis
Assim como para os anfíbios, para os répteis (p.ex. cobras, lagartos) foram aplicados os mesmos métodos de coleta. Foi registrado um total de 22 espécies, dessas, quatro são endêmicas da Mata Atlântica e uma do Cerrado, e cinco podem ser consideradas raras localmente ou regionalmente.